十二月初，等朱大能带领主力继续西进后，马黑麻又带领四千精锐，从天山山谷中冲了出来，杀了龟兹守城明军一个措手不及，烧毁明军一批辎重。幸亏后面的明军战车营及时赶到，将马黑麻又撵进了天山山谷之中。
随后明军用五十辆战车封锁住天山谷口，马黑麻只好带领三千残兵败将爬冰卧雪，翻越冰川峡谷北上，等到达伊犁河谷东部的达那拉堤草原时，剩下不到两千人，战马尽失。
十二月底，朱大能率领的南路军主力终于到达南疆重镇疏勒附近。此时明军已是人困马乏，干粮用尽。
好在这里的回鹘和葛逻?部落在历史上和中原渊源颇深，曾经建立过和宋朝关系十分友好的喀喇汗王朝，对明军十分友好。
随征的巩昌伯郭骥曾经下过西洋，不仅熟悉回鹘、葛逻?部落的语言，也熟悉他们的宗教习惯，凭着一张三寸不乱之舌，很快和周边的部落首领打成一片，借来一些粮食，让明军站稳了脚跟。
不久，在郭骥的劝说下，回鹘首领阿里和葛逻?首领赛依德亲往明军大营参观。
朱大能先请两位首领重点观看了明军火炮和火枪射击之术，把这些没见过世面的草原首领震得外焦里嫩，当场表示效忠大明。
武定侯乘势拿出辽王提前给的一张空白谕书，填上几行字，代表大明皇帝册封阿里为正汗，称阿尔斯兰喀喇可汗，赛依德为副汗，称博格拉喀喇可汗，命令二汗同心同德，协助大明治理安西旧地，共同对抗帖木儿汗国。
转眼就到了洪武二十六年。
一月份，武定侯郭英和朱大能带领一万出头的明军和三万回鹘、葛逻?联军开始在疏勒周边草原纵横驰骋，先后攻占大小城池近十座，连续斩俘四万帖木儿骑兵。
一月底，明番联军正式进围疏勒。
此时，离辽王给的三个月返程期限也没几天时间了。帖木儿也派四皇子沙哈鲁带领援军到了疏勒。
为了遏制明军的火器优势，沙哈鲁这次专门带来了三千火枪兵和十门大炮，使得疏勒守军一下子有了二十门大炮，四千支火枪。
这些火绳枪和仿制的燧发枪精度虽然没有明军的好，射程也没明军的远，但是集中起来，对明军的杀伤力还是极大的。
由于没有山炮的支援，朱大能率领大军连续几次强攻疏勒，都因城头火力太猛，未能成功，反而遭受重大损失，曾经在张斧手下屡立战功的胡骑营长柴勇也身受重伤。
形势对明越来越不利。
对峙到二月底，大能在疏勒城下已经逾期二十多天，弹药也所剩不多，仍然未能攻下疏勒。
六千京军骑兵自进入西域以来，已经因连续作战或因病减员过半，开始牢骚满腹。他们到西域本是奉旨救援辽王而来，现在辽王已安然无恙，却要继续征战西域。
名义上的南路军总指挥武定侯郭英和他手下两位京军指挥使眼看军心不稳，都劝大能退军。
杀红眼的朱大能决定在疏勒附近筑城，就地坚守待援，非要拿下疏勒不可。